特定の通信についてのみ遅延をかけたり、パケットを破棄させるというような設定は可能でしょうか。

Netropyの『Packet Classifier（パケット分類）』機能により可能です。エミュレーション・エンジン１基
（２ポートで１基）あたり最大１５本の仮想通信路を作成することができます。各通信路には異なる帯域幅、
遅延、パケットロスなどのエミュレーション設定を設定することができます。
次にパケットをどの通信路（パス）を通過させるかをIPアドレス、MACアドレス、VLANタグ等に基づいて
決定します（ルール）。